Dr. Wafaa Choumane

Nom: Wafaa Choumane L'adresse 1: Faculté d'agronomie, Université de Tishreen, B.P. 2099, Lattaquié, Syrie. TèlèFax: 00963-41-469040 E-mail: wafaa627@scs-net.org L'adresse 2: Centre International de recherches agronomiques dans les regions seches (ICARDA), Alep, Syrie. Fax: 00963-21-2213490 E-mail1: w.choumane@cgiar.org E-mail2: wchoumane@arabscientist.org

• Qualifications académiques:
  1. Diplôme d'études approfondies (D.E.A.) en Biologie Moléculaire et Cellulaire, Département de Biologie Générale et Appliquée. Université de Claude Bernard - Lyon I, France. Le titre du rapport technique du D.E.A: "Caractérisation moléculaire de l'unité ribosomique d'ADNr nucléaire du tournesol (Helianthus annuus)"
  2. Ph.D. en Biologie Moléculaire, Département de Biologie Générale et Appliquée, Université de Claude Bernard - Lyon I, France. Le titre de la thèse: "Analyse de la variabilité génétique dans le genre Helianthus a travers la structure des gènes ribosomiques

• Le travail actuel
  1. Professeur et chef du département de sciences fondamentales a la faculté d'Agronomie, Université de Tishreen, Lattaquié, Syrie.
  2. Consultante (temps partial) a l 'international Center for Agriculture Research in the Dry Areas (ICARDA), a Alep, Syrie.

• Activités principales, Recherches:
  1. De 1985 jusqu'à 1988 : Le travail a été réalisé sur le tournesol (Helianthus annuus ) et les espèces appartenant au genre Helianthus. Les buts étaient: Caractérisation et établissement de la carte de restriction des gènes ribosomiques chez le tournesol, Comparaison des unités d'ADNr et détermination des variabilités entre les différentes espèces du genre et établissement de l'arbre génétique du genre Helianthus base sur les informations des gènes ribosomiques. Ce travail a nécessité la réalisation des digestions enzymatiques et des hybridations moléculaires avec des sondes radioactives, l'isolement des gènes ribosomiques de l'espèce modèle (Helianthus annuus), les cloner et les sous-cloner dans des vecteurs (Phages et plasmides) pour les utiliser dans les études de comparaison entre les différentes espèces.
  2. De 1992-1993: Le travail a été effectue sur le pois chiche dans le but d'avoir des marqueurs moléculaires permettant l'identification de différentes variétés de pois-chiche. En utilisant des oligonucleotides digoxygenes et avec différentes combinaisons sondes/enzymes, des empreintes génétiques spécifiques permettant de distinguer entre les différents génotypes ont été déterminées.
     
  3. De 1994-1996: Le travail a été consacre à l'utilisation des techniques de RFLP et PCR-RAPD dans des études d'estimation des distances génétiques entre différents génotypes de l'orge. Ces résultats ont été utilises pour l'identification des génotypes et des lignées double haploïdes, pour l'analyse des ségrégations des F5 et de prévoir l'effet de la vigueur hybride.
  4. De 1996-1998: Le travail a été consacre à l'étude de biodiversité chez l'orge et le pois chiche. Concernant l'orge, L'ICARDA possède une grande collection de l'orge et essaye d'établir des " cores collections " pour éviter la présence des duplications a l'intérieur de la collection. L'étude a été réalisée sur la collection de la région de WANA. Nous avons utilisé la technique de PCR-RAPD pour caractériser et identifier les différents génotypes et pour estimer la variabilité génétique et la diversité présentes dans cette collection. Concernant le genre Cicer, le travail a été divise en 2 parties. La première a été réalisée sur les espèces sauvages et la deuxième a été effectuée sur l'espèce cultivée dans une étude de biodiversité sur la collection présente à l'ICARDA. Pour les espèces sauvages, des marqueurs de microsatellites ont été utilises. Des profils spécifiques de chaque espèce ont été déterminés. Des variabilités ont été détectées entre et parmi les espèces, une relation phylogénique basée sur les résultats des microsatellites a été établie.
  5. De 1999 - 2001 : Le travail a été débuté sur la lentille pour détecter de (s) gène (s) de résistance contre la Sitona et le (s) transférer aux espèces cultivées. Des techniques moléculaires, RAPD et AFLP ont été utilises pour trouver des marqueurs lies aux gènes intéressants. Une etude de biodiversite chez le pin en Syrie est en cours en utilisant des marqueurs moleculaires PCR-RAPD et AFLP. Un autre travail a été entame dans le but d'identifier et de caractériser les gènes de dehydrine impliques dans la procédure de résistance a la sécheresse chez l'orge. Les techniques basées sur les ARN messagers sont utilisées pour synthétiser des cDNA et les étudier en détaille.

• Enseignements: Enseigner à la faculté d'Agronomie dans les domaines suivants:
  1. Génétique Classique
  2. Biologie Moléculaire
  3. Génie Génétique
  4. Anatomie des plantes

• Supervision et Formation:
  1. Encadrer des étudiants en Maîtrise pour réaliser de petits projets de recherches.
  2. Encadrer des étudiants en Master et Ph.D.
  3. Co-superviser des cours de formation en Biotechnologie a l'ICARDA: " Utilisation des marqueurs moléculaires d'ADN dans l'amélioration des plantes", septembre 1994, 1995, 1997 et 2001 a l'ICARDA, Alep, Syrie. En 1999 a Rabat, au Maroc.

• Publications: Articles et thèses :
  1. Choumane W. (1985) . Structure et évolution des gènes ribosomiques végétaux. Comparaison avec les ADNr animaux et procaryotiques. Etude bibliographique pour Obtenir le degré du D.E.A. Département de Biologie Générale et Appliquée, Université de Claude Bernard - Lyon I, France.
  2. Choumane W. (1985) . Caractérisation moléculaire de l'unité ribosomique de l'ADNr nucléaire chez le tournesol (Helianthus annuus). Thèse pour le degré du D.E.A. Département de Biologie Générale et Appliquée, Université de Claude Bernard - Lyon I, France.
  3. Choumane W. and Heizmann P. (1988). Structure and variability of nuclear ribosomal gènes in Helianthus annuus. Theor. Appl. Genet. 76: 481-489. (en anglais).
  4. Choumane w. (1988). Analyse de la variabilité génétique dans le genre Helianthus à travers la structure des gènes ribosomiques". Thèse pour le degré de Ph.D. Département de Biologie Générale et Appliquée, Université de Claude Bernard - Lyon I, France.
  5. Choumane W. and Weigand F. (1995). Caracterisation de varietes de pois chiche par l'empreinte genetique de l'ADN. J. de l'universite deTishreen , vol : 34 (en arabe).
  6. Choumane W., Ashtar S. and Weigand F. (1999) . Evaluation de diversite genetique chez l'orge a travers les marqueurs moléculaires Al- Manara. J. vol 4, 2: 11-22. (en arabe).
  7. Huttel B., Winter P., Weising K., Choumane W. Weigand F. and Kahl G. (1999) . Sequence-tagged microsatellite site markers for chickpea (Cicer arietinum L.). Genome 42: 1-8 (en anglais).
  8. Ashtar S., Choumane W., Ghazal H., and Baum M. (1999). Evaluation de variabilite genetiques chez une core collection de l'orge par les marqueurs d'ADN. J. de l'universite d'Alep. Vol: 33 (en arabe).
  9. Choumane W., Winter P. Weigand F. and Kahl G. (2000) . Conservation and Variability of Sequences Tagged Microsatellite Sites from Chickpea (Cicer arietinum) within the genus Cicer. Theor Appl Genet . 101: 269-278 (en anglais).
  10. Choumane W., Ghazal H., Ashtar S. and Baum M. (2000). Diversite genetique chez l'orge syrien a travers les marqueurs de RAPD. J. de l'universite du roi Saud. No= 99. (en arabe).
  11. Choumane W. Baum M. (2001). Conservation of Sequence Tagged Microsatellite Sites (STMSs) between Cicer and Pisum. J. de l'universite deTishreen , (Accepte). (en anglais)
  12. Choumane W. (2001). Les relatiosns phylogeniques entre les especes annuelles du genre Cicer basees sur les marqueurs moléculaires J. de l'universite deTishreen , (Accepte). (en arabe)

• Thèses, conférences et symposiums:
  1. Choumane W. , Heizmann p. and Berville A. (1986). Structure et variations de genes ribosomiques dans le genre Helianthus. Poster presentation. International Symposium on Plant Molecular Biology. Strasbourg, France. 1-4 Juillet (en anglais).
  2. Choumane W. and Heizmann P. (1987). Structure et variations de l'ADN nucléaire dans le genre Helianthus. Comparaison entre H.annuus et H. Tuberosus. Poster présentation. Session D. Organisation et Expression des Génomes nucléaires et cytoplasmiques. Premier Forum de Jeunes Chercheurs de la Société Française de Physiologie Végétale. Université de Paul Sabatier, Toulouse, France. 18 - 19 juin (en francais).
  3. Choumane W. (1992). Identification et comparaison des rDNA de soixante espèces du genre Helianthus. Proceedings de la 32 semaines scientifiques, Damas, Syrie, 7-13 novembre.
  4. Choumane W. (1993). Utilisation des moyennes de biotechnologie pour l'estimation de distance genetic dans le genre. La seconde conference arabe en biotechnologie. Perspectives de la biotechnologie moderne. Amman, Jordane, 24-28 Avril.
  5. Choumane W., Weigand F. and Udupa S. (1994) . Application des marqueurs moléculaires dans l'identification des varietes et dans l'estimation des variations interspecifiques chez les populations de pois chiche. In: Proceedings of Symposium of Application of DNA Fingerprinting to Crop Improvement: Molecular marker assisted breeding of chickpea. ICARDA, Alep, Syrie, April 11-14.
  6. Choumane W. and Weigand F. (1994) . Détermination de l'empreinte génétique de l'ADN chez le pois chiche et ses applications agronomiques. Proceedings de la 34 semaines scientifiques . Damas, Syrie, 5-7 novembre.
  7. Choumane W. and Weigand F. (1996) . Estimation de la distance génétique entre différents génotypes de l'orge en utilisant les techniques de RFLP et PCR-RAPD. Proceedings of the 36th Science Week. Aleppo, Syria, November 2-11.
  8. Choumane W., Ashtar S. Valkoun J. and Weigand F. (1997). Utilisation des marqueurs moleculaires dans une etude de la bidiversite chez l'orge. Le troisieme international Symposium pour la Triticeae, IPGRI, 4-8 Mai. Alep, Syrie.
  9. Choumane W., Ashtar S. and Weigand F. (1997) . Biodiversite chez l'orge evaluee par des marqueurs moleculaires. Symposium "Biotechnologie: présence et future perspectives". 7-8 avril , Amman, Jordanie
  10. Winter P., Huttel B., Pfaff T., Wolf H., Weigand F., Udupa S., Choumane W., Saxena M., Muehlbauer F., Kahl G. (1998). Marqueures moléculaires et diversite genetiques chez le pois chiche (Cicer arietinum). Page: 200 in 3rd European conference on grain legumes: Opportunities for high quality, healthy and added value crops to meet European demands. Proceeding, AEP/UNIP/PGRO, 14-19 November, Valladolid, Spain.
  11. Ashtar S., Choumane W., Ghazal H. and Baum M. (1998). Utilisation des marqueurs moléculaires STMS dans l'estimation de diversite genetique chez une core collection de l'orge. Le caire, Egypt. 24-28 December , 1998.
  12. Choumane w. and Baum M. (2000). Utilisation des marqueurs moléculaires RAPD pour la characterisation des especes annuelles du genre Cicer. Le caire , Egypt 20-22/11/2000.
  13. Choumane w. and Baum M. (2001). Developement des marqueurs moléculaires lies a la resitance contre Sitonia critinusH. Chez la lentille.La premiere conference internationale de biotechnologie dans les regions arides. Kuwait , Avril, 9-11 .